Moteur: BMW S54B32

En 2001, le moteur du roadster a été remplacé par le S54 de la nouvelle M3. La cylindrée était désormais de 3 246 cm3 et la puissance est passée à 343 ch, comme sur la M3. En outre, la nouvelle MF3 a été équipée d'une boîte de vitesses manuelle à 6 rapports au lieu de l'ancienne à 5 rapports. Cette variante est restée au programme jusqu'à la fin de la production en 2011 et était le modèle d'entrée de gamme de Wiesmann. La MF3 n'a pas d'airbag passager.